表觀遺傳組測序之ATAC-seq與Cut&Tag在原理、功能、應用上的區(qū)別

   圖1 ATAC-seq原理圖

圖2 Cut&Tag原理圖 

• ATAC-seq：無需抗體！靠 Tn5 轉座酶 “盲掃” 染色質(zhì)開放區(qū)，像隨機配送的快遞員，只進開著門的區(qū)域。
• Cut&Tag：必須用抗體！先讓抗體定位目標蛋白，再引導 Tn5 精準切割，像帶導航的快遞員，只送指定地址。

• ATAC-seq：通常需要 50,000-100,000 個細胞（單細胞技術雖成熟，但對樣本量仍有要求）。
• Cut&Tag：理論上 10 個細胞就能做�。ㄐ率纸ㄗh 5000-100,000 個）臨床微量穿刺樣本、胚胎細胞都能適配，堪稱 “微量樣本救星”。

• ATAC-seq：覆蓋全基因組，需 30-50M reads，測序費用偏高（畢竟是 “全景掃描”）。
• Cut&Tag：僅測目標區(qū)域，10-30M reads 足夠，省下來的預算能多做 2 組重復實驗！