English | 中文版 | 手機(jī)版 企業(yè)登錄 | 個(gè)人登錄 | 郵件訂閱
生物器材網(wǎng) logo
生物儀器 試劑 耗材
當(dāng)前位置 > 首頁(yè) > 技術(shù)文章 > BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)與10x Genomics測(cè)序平臺(tái)的比較分析

BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)與10x Genomics測(cè)序平臺(tái)的比較分析

瀏覽次數(shù):480 發(fā)布日期:2025-12-30  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
一、BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)的技術(shù)優(yōu)勢(shì)
BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)憑借其基于微孔板捕獲與分子標(biāo)簽的技術(shù)路徑,在單細(xì)胞分析領(lǐng)域展現(xiàn)出獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。該平臺(tái)通過確定性細(xì)胞分選機(jī)制,將單個(gè)細(xì)胞精確分配至含有條形碼磁珠的納升微孔中,實(shí)現(xiàn)了高效的細(xì)胞捕獲與標(biāo)記。其技術(shù)特色主要體現(xiàn)于以下幾個(gè)方面:

首先,在實(shí)驗(yàn)適應(yīng)性方面,該平臺(tái)對(duì)細(xì)胞活性的要求相對(duì)較低(>50%),這一特性使其在處理臨床樣本等細(xì)胞活性可能受損的復(fù)雜材料時(shí)具備顯著優(yōu)勢(shì)。其次,平臺(tái)采用靈活可調(diào)的檢測(cè)方案設(shè)計(jì),用戶可根據(jù)研究需求在"全轉(zhuǎn)錄組"與"靶向Panel"模式間進(jìn)行選擇,為目標(biāo)基因檢測(cè)提供更高的測(cè)序深度與成本效益。此外,系統(tǒng)通過成像監(jiān)控機(jī)制有效控制雙聯(lián)體率,提升了單細(xì)胞數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。 

二、10x Genomics與BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)的技術(shù)差異
在主流的高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序領(lǐng)域,10x Genomics的Chromium平臺(tái)與BD的Rhapsody平臺(tái)代表了兩種主要的技術(shù)路徑,其核心差異體現(xiàn)在細(xì)胞捕獲原理、文庫(kù)構(gòu)建策略及適用場(chǎng)景上,為研究者提供了互補(bǔ)性的技術(shù)選擇。

細(xì)胞捕獲與標(biāo)記原理:10x Genomics主要采用基于微流控油滴包裹的GemCode技術(shù),將單個(gè)細(xì)胞與帶有獨(dú)特分子標(biāo)識(shí)符(UMI)的磁珠共同封裝在油滴內(nèi),完成逆轉(zhuǎn)錄與條形碼標(biāo)記,通量高且流程自動(dòng)化程度強(qiáng)。而BD Rhapsody平臺(tái)則基于微孔板捕獲原理,通過確定性細(xì)胞分選將細(xì)胞分配至含有條形碼磁珠的納升微孔中,其優(yōu)勢(shì)在于細(xì)胞捕獲效率高、樣本損失率低,并能實(shí)現(xiàn)更靈活的細(xì)胞捕獲前篩選或標(biāo)記實(shí)驗(yàn)。

文庫(kù)構(gòu)建與數(shù)據(jù)分析邏輯:在文庫(kù)制備方面,10x的方案為基于油滴的一次性全轉(zhuǎn)錄組捕獲,流程標(biāo)準(zhǔn)化。BD則采用“靶向”或“全轉(zhuǎn)錄組”可切換的Panel設(shè)計(jì),允許用戶根據(jù)研究目標(biāo)定制目標(biāo)基因集,在特定研究方向上可能獲得更高的測(cè)序深度與成本效益。下游生物信息學(xué)分析流程因此各有側(cè)重,10x生態(tài)擁有更龐大的公共數(shù)據(jù)集與標(biāo)準(zhǔn)化分析工具(如Cell Ranger),而BD的數(shù)據(jù)則需依賴其配套的分析套件或更靈活的定制化分析流程。

應(yīng)用場(chǎng)景選擇:綜上所述,選擇何種平臺(tái)取決于具體科學(xué)問題。當(dāng)研究側(cè)重于發(fā)現(xiàn)未知細(xì)胞類型、進(jìn)行無(wú)偏倚的細(xì)胞圖譜繪制,且需要處理大量樣本時(shí),10x的高通量、標(biāo)準(zhǔn)化流程更具優(yōu)勢(shì)。反之,若研究聚焦于特定細(xì)胞亞群、稀有細(xì)胞或需要更高目標(biāo)基因檢測(cè)靈敏度與測(cè)序深度,例如在腫瘤免疫或干細(xì)胞分化等領(lǐng)域進(jìn)行深度機(jī)制挖掘,BD平臺(tái)的靶向性與靈活性則可能提供更優(yōu)化的解決方案。兩者共同推動(dòng)了單細(xì)胞研究向更精細(xì)、更深入的方向發(fā)展。

三、10x Genomics Chromium與BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)核心參數(shù)比較
比較維度 10x Genomics Chromium BD Rhapsody
核心實(shí)驗(yàn)參數(shù)    
單次文庫(kù)構(gòu)建成本(約) 1600美元 1400美元
標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)流程耗時(shí) ~8小時(shí) ~10小時(shí)
細(xì)胞活性要求 >80% >50%
推薦上樣細(xì)胞數(shù) 500 - 25,000個(gè) 2,000 - 40,000個(gè)
預(yù)計(jì)回收細(xì)胞數(shù) 100 - 16,000個(gè) 100 - 25,000個(gè)
技術(shù)原理與特性    
單細(xì)胞分離原理 微流控油滴包裹 微孔板捕獲
RNA捕獲磁珠 凝膠磁珠 磁性磁珠
全長(zhǎng)cDNA合成 是(基于TSO模板轉(zhuǎn)換) 否(基于RPE隨機(jī)引物延伸)
雙聯(lián)體率控制 依賴微流控優(yōu)化 較低(可通過成像系統(tǒng)監(jiān)控與篩選)
功能與應(yīng)用范圍    
單細(xì)胞基因表達(dá)譜 支持 支持
細(xì)胞表面蛋白檢測(cè) 支持(CITE-seq) 支持(BD AbSeq)
免疫受體譜分析 支持(VDJ) 支持(VDJ)
單細(xì)胞ATAC-seq 支持 不支持
流程與操作性    
流程自動(dòng)化程度 高,高度標(biāo)準(zhǔn)化 中等,手動(dòng)操作環(huán)節(jié)較多
實(shí)驗(yàn)中途安全暫停點(diǎn) 5個(gè) 4個(gè)
單次運(yùn)行樣本數(shù) 可多樣本混合(依賴于芯片) 通常為單一樣本
主要優(yōu)勢(shì) 通量高、操作標(biāo)準(zhǔn)化、細(xì)胞回收率高、多組學(xué)整合生態(tài)完善 對(duì)細(xì)胞活性要求更寬松、雙聯(lián)體率低、可靶向定制Panel
主要局限 對(duì)樣本新鮮度要求高、需較高細(xì)胞活性、檢測(cè)mRNA分子比例有限 對(duì)起始細(xì)胞數(shù)量要求較高、手動(dòng)操作多、通量相對(duì)受限

總結(jié)與選擇建議: 10x Genomics Chromium平臺(tái)憑借其標(biāo)準(zhǔn)化流程、高回收率及強(qiáng)大的多組學(xué)生態(tài),適用于追求高通量、系統(tǒng)性探索性研究或樣本量有限的課題。BD Rhapsody平臺(tái)則在處理細(xì)胞活性較低的復(fù)雜樣本(如臨床組織)方面更具韌性,其低雙聯(lián)體率和靶向設(shè)計(jì)有利于提高目標(biāo)基因檢測(cè)的靈敏度與準(zhǔn)確性,適用于對(duì)數(shù)據(jù)精準(zhǔn)度有特殊要求、且能提供足量細(xì)胞的研究場(chǎng)景。研究者應(yīng)根據(jù)具體的科學(xué)問題、樣本條件與實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)進(jìn)行選擇。

四、技術(shù)發(fā)展與展望
隨著單細(xì)胞技術(shù)的持續(xù)發(fā)展,BD平臺(tái)有望在多個(gè)方向?qū)崿F(xiàn)進(jìn)一步優(yōu)化:實(shí)驗(yàn)流程的自動(dòng)化改進(jìn)將提升操作效率;數(shù)據(jù)分析流程的完善將增強(qiáng)數(shù)據(jù)解讀能力;應(yīng)用范圍的拓展將為更廣泛的研究領(lǐng)域提供支持。這些發(fā)展將使該平臺(tái)在單細(xì)胞研究生態(tài)中保持重要地位,為生命科學(xué)研究提供更強(qiáng)大的技術(shù)支持。

總而言之,BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)憑借其獨(dú)特的技術(shù)特性和應(yīng)用優(yōu)勢(shì),在單細(xì)胞研究領(lǐng)域發(fā)揮著不可替代的作用。平臺(tái)的技術(shù)特點(diǎn)使其特別適合處理復(fù)雜的臨床樣本和進(jìn)行靶向性深入研究,為科研工作者提供了重要的技術(shù)選擇。隨著技術(shù)進(jìn)步和應(yīng)用拓展,該平臺(tái)將繼續(xù)推動(dòng)單細(xì)胞研究向更高精度、更深層次的方向發(fā)展。

五、BD單細(xì)胞測(cè)序哪個(gè)公司提供?
LabEx依托BD Rhapsody™單細(xì)胞多組學(xué)平臺(tái),為您提供從樣本處理到數(shù)據(jù)洞察的全流程BD單細(xì)胞測(cè)序解決方案。該平臺(tái)基于微孔板與分子索引技術(shù),結(jié)合高通量測(cè)序,可實(shí)現(xiàn)對(duì)數(shù)千至上萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞進(jìn)行高捕獲率、高靈敏度的轉(zhuǎn)錄組、蛋白組或免疫組庫(kù)分析。

服務(wù)名稱 服務(wù)內(nèi)容
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(ScRNA-seq) 在單細(xì)胞水平對(duì)全mRNA表達(dá)譜進(jìn)行檢測(cè)
單細(xì)胞蛋白檢測(cè)(Ab-seq) 在單細(xì)胞水平同時(shí)檢測(cè)蛋白和基因表達(dá)的多組學(xué)研究,針對(duì)人蛋白249個(gè)+小鼠蛋白219個(gè)抗體,更大panel可定制
單細(xì)胞免疫組庫(kù)測(cè)序 富集TCR/BCR基因并測(cè)序,實(shí)現(xiàn)免疫組庫(kù)多樣性,多種屬檢測(cè)

樂備實(shí)是國(guó)內(nèi)專注于提供高質(zhì)量蛋白檢測(cè)以及組學(xué)分析服務(wù)的實(shí)驗(yàn)服務(wù)專家,自2018年成立以來(lái),樂備實(shí)不斷尋求突破,公司的服務(wù)技術(shù)平臺(tái)已擴(kuò)展到單細(xì)胞測(cè)序、空間多組學(xué)、流式檢測(cè)、超敏電化學(xué)發(fā)光、Luminex多因子檢測(cè)、抗體芯片、PCR Array、ELISA、Elispot、PLA蛋白互作、多色免疫組化、DSP空間多組學(xué)等30多個(gè),建立起了一套涵蓋基因、蛋白、細(xì)胞以及組織水平實(shí)驗(yàn)的完整檢測(cè)體系。

原文點(diǎn)擊:BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)技術(shù)評(píng)述及其與10x Genomics的比較分析
發(fā)布者:上海優(yōu)寧維生物科技股份有限公司
聯(lián)系電話:15921930842
E-mail:yh-wang@univ-bio.com

標(biāo)簽: 單細(xì)胞測(cè)序
用戶名: 密碼: 匿名 快速注冊(cè) 忘記密碼
評(píng)論只代表網(wǎng)友觀點(diǎn),不代表本站觀點(diǎn)。 請(qǐng)輸入驗(yàn)證碼: 8795
Copyright(C) 1998-2026 生物器材網(wǎng) 電話:021-64166852;13621656896 E-mail:info@bio-equip.com