INTEGRA自動(dòng)化移液方案助力全球最大scRNA-seq數(shù)據(jù)集

單細(xì)胞RNA測(cè)序（scRNA-seq）正在迅速成為藥物研發(fā)中的標(biāo)準(zhǔn)方法，在多個(gè)治療領(lǐng)域內(nèi)逐漸取代傳統(tǒng)的混合RNA測(cè)序技術(shù)。總部位于加利福尼亞州舊金山的Tahoe Therapeutics正在使用scRNA-seq技術(shù)來(lái)生成全球最大的單細(xì)胞數(shù)據(jù)集。該公司將ASSIST PLUS移液工作站與Parse Biosciences的Evercode™技術(shù)相結(jié)合，以流暢推進(jìn)其研究突破，提高可靠性，并將手工操作時(shí)長(zhǎng)縮短高達(dá)75%。

藥物研發(fā)中的單細(xì)胞RNA測(cè)序
Tahoe Therapeutics（原Vevo Therapeutics）成立于2022年，其目標(biāo)是利用單細(xì)胞RNA測(cè)序技術(shù)（scRNA-seq）構(gòu)建全球最大的圖譜來(lái)描繪藥物如何與患者細(xì)胞相互作用。該公司已針對(duì)多種癌癥類(lèi)型并行開(kāi)展了數(shù)個(gè)項(xiàng)目，并且目前正在將研究擴(kuò)展到更廣泛的治療領(lǐng)域，包括心血管、代謝以及神經(jīng)退行性疾病等。

Tahoe Therapeutics之所以選擇這種方法，是因?yàn)?scRNA-seq能夠產(chǎn)出的數(shù)據(jù)量遠(yuǎn)超傳統(tǒng)測(cè)序工作流程。公司聯(lián)合創(chuàng)始人兼首席科學(xué)官Johnny Yu解釋說(shuō)：“scRNA-seq使我們得以深入了解不同細(xì)胞類(lèi)型對(duì)藥物的不同反應(yīng)，而常規(guī)的混合測(cè)序則很難揭示這些差異。我們使用高通量方法在單細(xì)胞水平上產(chǎn)生了大量數(shù)據(jù)。公司的首個(gè)數(shù)據(jù)集Tahoe 100 million是該領(lǐng)域有史以來(lái)規(guī)模最大的。實(shí)際上，它將過(guò)去十年累計(jì)生成的公開(kāi)數(shù)據(jù)總量翻了一番。”

自動(dòng)化優(yōu)化工作流程
Tahoe Therapeutics利用復(fù)雜的生物模型系統(tǒng)開(kāi)發(fā)了自己的生物檢測(cè)方法。近日，公司使用Parse Biosciences的Evercode試劑盒來(lái)進(jìn)行單細(xì)胞RNA測(cè)序（scRNA-seq），以確保數(shù)據(jù)生成的可擴(kuò)展性，從而為其藥物研發(fā)模型提供信息。該公司的目標(biāo)是構(gòu)建全球最大的scRNA-seq數(shù)據(jù)集，因此，實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化對(duì)其團(tuán)隊(duì)而言至關(guān)重要。“我們很快便意識(shí)到，隨著生成的數(shù)據(jù)越來(lái)越多，不斷拓展該領(lǐng)域的邊界，我們也迫切地需要機(jī)器人和高通量的解決方案，”Johnny補(bǔ)充說(shuō)。

基于INTEGRA與Parse Biosciences的合作，前者的解決方案自然成為了Tahoe Therapeutics滿足其自動(dòng)化需求的首選，這些經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的全流程方案覆蓋了scRNA-seq樣品制備每個(gè)階段。Johnny及其團(tuán)隊(duì)使用ASSIST PLUS移液工作站配合8通道的VIAFLO手持式電動(dòng)移液器實(shí)現(xiàn)了Evercode sc-RNA-seq工作流程的自動(dòng)化。“ASSIST PLUS移液工作站的主要優(yōu)勢(shì)之一是其靈活性。該系統(tǒng)專(zhuān)門(mén)為Parse Evercode單細(xì)胞工作流程內(nèi)置了預(yù)設(shè)方案，同時(shí)我們也能快速編制不同的程序，以完成scRNA-seq樣品制備之外的各種任務(wù)。”Johnny解釋道：“這一點(diǎn)非常重要，因?yàn)橄裎覀冞@樣的小型實(shí)驗(yàn)室需要運(yùn)行很多不同的流程。”對(duì)于一個(gè)技能組合多樣的小團(tuán)隊(duì)而言，易于編程，能夠從容應(yīng)對(duì)多種任務(wù)是至關(guān)重要的。“ASSIST PLUS與其他昂貴的自動(dòng)化解決方案的重要區(qū)別之一在于，你不必是一位擁有多年系統(tǒng)經(jīng)驗(yàn)的自動(dòng)化工程師，”Johnny說(shuō)道。“我們的兩位方法開(kāi)發(fā)人員沒(méi)有任何自動(dòng)化背景，但他們卻能快速地將新方法推廣給團(tuán)隊(duì)的其他成員。”

該團(tuán)隊(duì)的工作流程需要基于精確的時(shí)間節(jié)點(diǎn)緊密協(xié)調(diào)，同時(shí)，活細(xì)胞的操作則必須快速而輕柔。INTEGRA自動(dòng)化解決方案的速度配合Parse Biosciences的產(chǎn)品，能夠并行處理大批量的生物樣本。隨著Tahoe Therapeutics研究規(guī)模的擴(kuò)大，其構(gòu)建的數(shù)據(jù)集規(guī)模將超過(guò)Tahoe 100 million這一創(chuàng)紀(jì)錄集合的50倍，因此，這套系統(tǒng)的速度、準(zhǔn)確性和可重復(fù)性將是至關(guān)重要的。“自動(dòng)化大大提高了我們的數(shù)據(jù)生成通量，使工作流程中的單細(xì)胞制備效率提升了5倍以上，”Johnny解釋道。“最重要的是，它非常精確——你不必再受制于手動(dòng)操作難以避免的差異性了。”
  出色的客戶服務(wù)與技術(shù)支持
INTEGRA的自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)室解決方案已成為公司運(yùn)營(yíng)的必備要素，因此，高水平的客戶服務(wù)與技術(shù)支持也變得非常重要。Tahoe Therapeutics團(tuán)隊(duì)享受了全天候的快速響應(yīng)服務(wù)，并且獲得了定制化的購(gòu)買(mǎi)建議來(lái)幫助其簡(jiǎn)化工作流程。“INTEGRA的服務(wù)和銷(xiāo)售是緊密結(jié)合的，我認(rèn)為這樣非常有幫助，”Johnny解釋道。“我與我們的銷(xiāo)售代表相熟，有一次甚至在她飛行途中聯(lián)系過(guò)，我相信她會(huì)站在我們團(tuán)隊(duì)一邊，找到解決當(dāng)前問(wèn)題的正確方案。我認(rèn)為這種關(guān)系是INTEGRA與眾不同的原因之一。”

渾然一體的液體處理和二代測(cè)序平臺(tái)
INTEGRA自動(dòng)化移液工作站與Parse Biosciences單細(xì)胞測(cè)序方案的結(jié)合，為T(mén)ahoe Therapeutics提供了一套協(xié)調(diào)統(tǒng)一的解決方案。ASSIST PLUS強(qiáng)大而直觀的編程與操作方式，加上INTEGRA出色的技術(shù)支持，使該公司得以不斷突破行業(yè)邊界，并且領(lǐng)先于使用老舊技術(shù)的競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手。“許多最新的生物制藥研究仍然基于混合RNA測(cè)序這種十年之前的方法，”Johnny說(shuō)。“我們所使用的技術(shù)使我們能夠超越眾多的生物制藥公司，以更少的儀器、試劑和資金構(gòu)建出更大的數(shù)據(jù)集。”

ASSIST PLUS廣泛適用于各種生命科學(xué)應(yīng)用，包括scRNA-seq。瀏覽我們的應(yīng)用頁(yè)面，了解這款功能強(qiáng)大的移液工作站如何簡(jiǎn)化您的實(shí)驗(yàn)室流程。