來自華盛頓大學的研究團隊開發(fā)了Fiber-seq 技術,通過非特異性N6- 腺嘌呤甲基轉移酶(m6A-MTase)將單個染色質纖維的結構 “標記” 在 DNA 模板上,結合PacBio HiFi測序,實現了 kilobase 級染色質纖維的核苷酸分辨率分析,該項研究成果于2020年發(fā)表于Science雜志。

Fiber-seq 設計巧妙,其技術優(yōu)勢體現在:
1)由于腺嘌呤在真核生物中幾乎無內源性甲基化,且分布均勻(每2個堿基1個),避免 CpG/GpC 的“聚類”和“沙漠化”問題;
2)實現單分子水平的染色質結構分析,而非群體平均值;
3)結合 PacBio HiFi 測序,實現單個DNA分子多次重復測序,保證堿基識別準確性(包括修飾堿基);
4)提供單倍型的檢測結果;
5)一次測序可以獲得基因組信息,5mC CpG島信息和染色質可及性信息,多維度挖掘基因組隱藏的價值;
6)無需 bisulfite 轉化,減少DNA 降解,結果重現性好。
Fiber-seq檢測染色質可及性原理


Fiber-seq 與DNasel-seq和AdMTase-seq的結果比較,其標記分布與 DNase-seq結果高度一致。
實驗證明Fiber-seq可以應用于哺乳動物,昆蟲和植物,擁有廣泛的物種普遍性。未來隨著PacBio HiFi測序讀長和通量的提升,Fiber-seq有望成為解析全基因組單倍型調控,同時映射遺傳序列和染色質狀態(tài)的標準實驗方法。
PacBio將會參加8月21-25日在四川成都都江堰舉辦的2025表觀遺傳與染色質生物學大會。如您對HiFi測序和Fiber-seq感興趣,歡迎您來PacBio展位(特2展位)交流和咨詢。
關于PacBio
PacBio (納斯達克股票代碼:PACB) 是一家領先的生命科學技術公司,致力于設計、開發(fā)和制造先進的測序解決方案,幫助科學家和臨床研究人員解決復雜的遺傳問題。我們的產品和技術源自兩項高度差異化的核心技術,專注于準確性、質量和完整性,包括我們的HiFi長讀長測序和我們的 SBB® 短讀長測序技術。我們的產品為廣泛的研究應用提供解決方案,包括人類生殖系測序、植物和動物科學、傳染病和微生物學、腫瘤學和其他新興應用。欲了解更多信息,請訪問www.pacbio.cn。
*PacBio 產品僅供研究使用,不用于臨床診斷。

關于怡美通德
北京怡美通德科技發(fā)展有限公司成立于2003年,專業(yè)從事生命科學領域的儀器設備和試劑代理分銷以及相關技術服務,多年來通過與多個國際著名生物技術產品制造商的合作建立了完善的營銷渠道與服務體系。我們是一家專注于生命科學領域的綜合性方案提供商,致力于通過代理分銷高質量的生命科學產品和提供先進的生物技術服務,推動生命科學研究和應用的發(fā)展。我們擁有一支專業(yè)、高效的團隊,以及廣泛的合作網絡和資源,能夠為客戶提供全方位、一站式的解決方案。
北京怡美通德科技發(fā)展有限公司是PacBio的官方授權代理商,如果您想了解更多關于PacBio的信息,歡迎通過如下方式聯系我們:
官網|www.emtd.com.cn
Bilibili|怡美通德
微信公眾號 |怡美通德EMTD
微信視頻號 |怡美通德EMTD