BluePippin回收大片段DNA用于Nanopore測序

 

2020年2月份發(fā)表在《PLOS GENETICS》上的一篇文章中，研究人員利用秀麗隱桿線蟲Caenorhabditis elegans重組自交系(RIL)來研究遺傳變異所導致的物種適應性變化。他們通過鑒定發(fā)現(xiàn)了一株具有高度環(huán)境適應性的蟲株，此外該蟲株對周圍環(huán)境表現(xiàn)出了更強的探索性，而親本株并不具備這些特征。對該蟲株進行短讀測序發(fā)現(xiàn)rcan-1基因發(fā)生了復雜的自發(fā)重排。利用Oxford Nanopore長讀長測序技術將這種復雜的重排解析為5個獨特的串聯(lián)反轉/重復。作者認為，新的生存環(huán)境可以產生進化壓力，從而產生復雜的基因重排，這種重排除了可以增加基因拷貝數(shù)之外，還可以通過其他方式影響和改變基因表達。該文章中，BluePippin被用來分離和回收10-50kb的DNA片段，用于后續(xù)Oxford Nanopore MinION文庫制備。

小編短評：BluePippin可用于三代長讀長測序的文庫構建，專門用于回收大片段DNA，可有效提升三代測序的效率，提高測序數(shù)據的N50值。是三代測序的標配工具。

圖1：BluePippin用于Nanopore三代測序流程圖

Sage Science是全球領先的研發(fā)和制造Pippin系列全自動核酸電泳片段回收儀的生產廠家，擁有美國技術專利，其生產的Sage系列產品可以高效完成不同長度范圍的DNA片段的精準回收，廣泛用于二代測序、三代測序以及多個分子生物學相關領域。
 
環(huán)亞生物科技有限公司作為美國Sage Science公司在中國區(qū)的獨家代理商，自2011年以來將Sage Science的產品線引入國內，一直為國內用戶提供專業(yè)的全自動核酸片段回收系統(tǒng)的安裝測試、應用培訓，技術支持與售后維護工作，贏得客戶的一致好評與信任。環(huán)亞生物科技有限公司將一如既往地支持越來越多的Sage Science用戶。

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